Séquence répétée
Il y a trois « types » d'ADN répétés : il peut être hautement répétitif (=15 %), moyennement répétitif (=60 %) ou être sous forme de séquences uniques (=25 %). Chez l'homme, les séquences répétées représentent 50 % du génome. Dans les séquences d'ADN hautement répétitives, on distingue principalement trois types de séquences répétées :
- Séquences localisées répétées en tandem :
- ADN satellites : répété environ 5 000 fois, et se trouvent au niveau des centromères[Contradiction], il en existe différentes catégories.
- Séquences microsatellites : des séquences de 1 à 5 paires de bases sont répétées un grand nombre de fois, répétitions longues de plusieurs kilobases (Kb), il y a plus de 10 000 zones de répétition dans le génome.
- Séquences minisatellites : des séquences de 15 à 25 paires de bases (pb) sont répétées un grand nombre de fois (1000 à 2000 fois) . Ils sont télomériques[Contradiction], très polymorphes.
- Grands blocs d'ADN satellite (environ 10 % du génome humain) : blocs allant jusqu'à une dizaine de mégabases, localisés très majoritairement au niveau des centromères et télomères.
Il y a des possibilités d'erreurs lors de l'ajout des séquences monotones.
- Séquences répétées dispersées (chez les vertébrés), séquences apparentées, réparties sur l'ensemble du génome :
- Petits éléments nucléaires intercalés (SINE) : leur taille varie entre 130 et 500 pb, les plus abondantes chez l'homme sont les séquences ALU.
- Longs éléments nucléaires intercalés (LINE) : leur taille est de quelques kilobases ou plus précisément 6 000 à 7 000 pb.
- Séquences terminales longues répétées (LTR) : généralement des éléments de relativement petite taille, présents en très grand nombre (~ 400 000 copies).
- transposons d'ADN : ils représentent environ 300 000 copies et sont issus de la transposition de certains gènes d'une partie d'un chromosome, voire d'un chromosome complètement différent, vers une autre partie du génome.
- rétrotransposons : créés par l'intégration de rétrovirus non codant et pour la plupart dispersés physiologiquement dans la totalité du génome.
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